- Код статьи
- 10.31857/S0475145024020015-1
- DOI
- 10.31857/S0475145024020015
- Тип публикации
- Статья
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 55 / Номер выпуска 2
- Страницы
- 47-52
- Аннотация
- Тандемные повторяющиеся элементы, образующие протяженные полипуриновые/полипиримидиновые непрерывные последовательности обнаружены в геномах различных видов животных. Особенности их структуры способствуют изгибанию спирали ДНК и переходу к неканоническим формам вторичной структуры ДНК. В современной научной литературе можно встретить множество примеров участия таких элементов в регуляции экспрессии генов и образовании альтернативных транскриптов в клетках разных типов (Matos-Rodrigues et al., 2023). Ранее нами описан повторяющийся элемент (GGAAA)n курицы (Gallus gallus domesticus), который преимущественно локализован на половой хромосоме W и составляет около 1% генома самок (Komissarov et al., 2018). В данной работе мы выявили особенности локализации этого тандемного повтора в геноме курицы в составе аутосом и половой хромосомы Z. Был выявлен ряд генов, содержащих тандемно повторенные элементы (GGAAA)n в составе некодирующих транскрибируемых регуляторных районов, которые могут влиять на интенсивность экспрессии и образование альтернативных транскриптов. Функциональная характеристика генов, несущих блоки (GGAAA)n, позволила выдвинуть предположение об участии этих тандемных повторов в регулировании дифференциальной активности генов, важной для развития признаков полового диморфизма у курицы.
- Ключевые слова
- курица тандемные повторы полипуриновые/полипиримидиновые непрерывные последовательности анализ геномных данных дифференцировка пола
- Дата публикации
- 18.09.2025
- Год выхода
- 2025
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 13
Библиография
- 1. Bellott D.W., Skaletsky H., Cho T.-J. et al. Avian W and mammalian Y chromosomes convergently retained dosage-sensitive regulators // Nature Genetics. 2017. V. 49. № 387. P. 94.
- 2. Komissarov A.S., Galkina S.A., Koshel E.I. et al. New high copy tandem repeat in the content of the chicken W chromosome // Chromosoma. 2018. V. 127. № 1. P. 73–83.
- 3. Li Z., Zheng M., Abdalla B.A., Zhang Z. et al. Genome-wide association study of aggressive behaviour in chicken // Scientific reports. 2016. V. 6. № . 30981.
- 4. Lovell P.V., Huizinga N.A., Friedrich S.R. The constitutive differential transcriptome of a brain circuit for vocal learning // BMC Genomics. 2018. V. 19. № 1.
- 5. Matos-Rodrigues G., Hisey J.A., Nussenzweig A. et al. Detection of alternative DNA structures and its implications for human disease // Molecular Cell. 2023. V. 83. № 20. P. 3622–3641.
- 6. Maroteaux L., Heilig R., Dupret D. et al. Repetitive satellite-like sequences are present within or upstream from 3 avian protein-coding genes // Nucleic Acids Research. 1983. V. 11. P. 1227–1243.
- 7. Wada K., Sakaguchi H., Jarvis E. D. et al. Differential expression of glutamate receptors in avian neural pathways for learned vocalization // The Journal of Comparative Neurology. 2004. V. 476. P. 44–64.
- 8. Zopf D., Dineva B., Betz H., Gundelfinger E.D. Isolation of the chicken middle-molecular weight neurofilament (NF-M) gene and characterization of its promoter // Nucleic Acids Research. 1990. V. 18. № 3. P. 521–529.
