- Код статьи
- 10.31857/S0475145023020064-1
- DOI
- 10.31857/S0475145023020064
- Тип публикации
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 54 / Номер выпуска 2
- Страницы
- 172-175
- Аннотация
- В работе впервые исследовали организацию промоторов генов развития и генов, необходимых для общеклеточных функций – “домашнего хозяйства” клетки в полном геноме Drosophila melanogaster. С помощью биоинформатических методов показано, что гены, промоторы которых расположены в междисках политенных хромосом, обогащены функциями, связанными с общеклеточными процессами, тогда как остальная часть генов (примерно половина генома Drosophila) связана с узкоспециализированными процессами, происходящими в ходе развития. В промоторной зоне генов “домашнего хозяйства” обнаружено четыре специфичных мотива, которые могут присутствовать у разных генов индивидуально или в различных комбинациях. Существенная часть междисковых промоторов не содержит выявленных мотивов. Анализ, проведенный с помощью Gene Ontology, показал, что для отдельных групп междисковых генов, содержащих в промоторах один мотив или их комбинации, характерно выполнение определенных функций.
- Ключевые слова
- гены развития гены “домашнего хозяйства” промоторы генов мотивы нуклеотидов в промоторах междиски диски политенные хромосомы <i>Drosophila melanogaster</i>
- Дата публикации
- 18.09.2025
- Год выхода
- 2025
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 17
Библиография
- 1. Andersson R., Sandelin A. Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements // Nat. Rev. Genet. 2020. V. 21. P. 71–87.
- 2. Crick F. General model for the chromosomes of higher organisms // Nature. 1971. V. 234. P. 25–27.
- 3. Danino Y.M., Even D., Ideses D. et al. The core promoter: At the heart of gene expression // Biochim. Biophys. Acta. 2015. V. 1849(8). P. 1116–1131.
- 4. Koltzoff N.K. The structure of the chromosomes in the salivary glands of Drosophila // Science. 1934. V. 60. P. 312–313.
- 5. Lenhard B., Sandelin A., Carninci P. Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation // Nat. Rev. Genet. 2012. V. 13(4). P. 233–245.
- 6. Levitsky V.G., Zykova T.Yu., Moshkin Y.M., Zhimulev I.F. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in Drosophila interphase chromosomes // International J. Molecular Sciences. 2020. V. 21(23). P. 9282.
- 7. Paul J. General theory of chromosomes structures and gene activation in eukaryotes // Nature. 1972. V. 238. P. 444–446.
- 8. Ramalingam V., Natarajan M., Johnston J. et al. TATA and paused promoters active in differentiated tissues have distinct expression characteristics // Mol. Syst. Biol. 2021. V. 17. P. e9866.
- 9. Zhimulev I.F., Belyaeva E.S. Proposals to the problem of structural and functional organization of polytene chromosomes // Theor. Appl. Genet. 1975. V. 45(8). P. 335–340.
- 10. Zhimulev I.F., Zykova T.Yu., Goncharov F.P. et al. Genetic organization of polytene chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster // PLoS One. 2014. V. 9(7). P. e101631.
- 11. Zykova T.Yu., Levitsky V.G., Belyaeva E.S. et al. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome // Curr. Genomics. 2018. V. 19(3). P. 179–191.
